구제역 바이러스 Asia1 혈청형의 전체 염기서열과 이를 이용한 방어 유전형 분석

Abstract

OIE의 추천을 받아 백신주로 사용되고 있는 Asia1 Shamir는 우리나라를 비롯한 세계 여러 국가에서 발생에 대비해 준비되고 있는 백신 바이러스 주이지만 아직까지 그 바이러스에 대한 염기서열이 밝혀져 있지 않다. Shamir 백신주는 광범위한 공통항원성을 지니고 있을 것으로 추정되나 아직까지 분자생물학적인 분석은 미흡한 실정이다. 따라서 본 연구에서는 국내에 유입 가능성이 있는 Asia1형의 바이러스에 대비해 Asia1 Shamir 백신주의 5’, 3’ region을 포함한 전체 염기서열을 확인하고 Asia1 Shamir가 방어가능한 유전형을 분석하였다. 염기서열의 분석 결과, Asia1 Shamir의 전체 유전자 중 변이가 가장 심한 부위는 P1 부위의 1D region이었으며, 그 중 세포와 결합부위가 포함된 아미노산 140-157 부위였다. 또한 1D 단백질 중 5개 아미노산 부위가 알려진 Asia1 바이러스들과는 다른 특징적인 항원부위로 확인되었다. 또 유전적으로 중동 지역에서 발생했던 바이러스들이 속한 group VI와 유사함을 보였으며, 우리나라에 유입가능성이 높은 genotype인 group V에 속하는 동남아시아, 중국 등지에서 발생한 바이러스들과는 유전적 유사성이 낮은 것으로 나타났다. 만약 이 바이러스들이 우리나라에 유입될 경우 국내에서 확보하고 있는 백신주 Shamir는 접종 시에 신중할 필요가 있으며 새로운 바이러스를 이용하거나 백신을 개발할 필요가 있다고 여겨진다.