임상에서 분리된 vanA유전자를 지닌 Enterococcus faecalis의 내성유전자 구조분석

Alternative Title
KIM JOON
Author(s)
김준
Alternative Author(s)
KIM JOON
Advisor
남석현
Department
일반대학원 생명과학과
Publisher
The Graduate School, Ajou University
Publication Year
2012-02
Language
kor
Keyword
vanA Enterococcus faecalisTn1546
Abstract
배경 : 1986년 영국과 프랑스에서 반코마이신 내성 장알균 (Vancomycin-resistant enterococci, VRE)이 처음 보고된 이후 VRE의 분리빈도는 전 세계적으로 증가하였다. 이중 가장 흔히 분리되는 VanA형 VRE는 획득형 내성으로 Vancimycin과 Teicoplanin에 고도내성을 보여 병원 감염에서 감염관리의 주된 대상이다. 그중 임상에서 분리되는 Enterococcus species 의 많은 부분을 Enterococcus faecalis 가 차지하고 있음에도 불구하고 실제 VanA형 VRE의 대부분이 Enterococcus faecium 인 이유를 두 종간의 유전적 관련성과 함께 vanA 내성 유전자의 구조의 차이 및 병독성 인자인 esp 유전자의 유무 등의 분자생물학적 분석을 통하여 원인을 알아내고 향후 VRE의 감염관리에 참고자료로 이용하고자 하였다. 대상 및 방법 : 2001년 1월부터 2011년 9월까지 아주대학병원 진단검사의학과에 세균검사가 의뢰된 임상 검체중에서 VanA형 반코마이신 내성 Enterococcus faecalis 로 동정된 44균주를 대상으로 하였다. Disk diffusion법 및 E-test법을 이용하여 감수성 검사를 실시하여 최저발육저지농도를 측정하고 연쇄중합효소반응법 (PCR)으로 내성 유전자형을 확인 하였다. vanA 유전자 집단 (vanA gene cluster;Tn1546)의 내부를 대상으로 부분별 16개의 primer를 준비하여 PCR을 시행하여 구조를 분석하고, Insertion sequence (IS)유전자의 삽입이 의심되는 부분에 대해 DNA 염기서열 분석기를 이용하여 염기서열을 분석하였다. 균 분석은 Sma I 으로 균의 DNA를 절단한 후 CHEF-DRⅡ를 이용하여 전기영동 시킨 후 균주들 간의 유전적 연관성을 Bio-gene software를 이용하여 분석하였다. 장알균의 병독성 인자로 알려진 esp 유전자의 시발체를 이용하여 esp 의 유무 검색을 시행하였다. 결과 : vanA내성 유전자 구조 분석 결과는 5가지 유형으로 구별되었다. prototype과 동일한 I형 1균주(2.3%), Ia형 1균주(2.3%), Ib형 1균주 (2.3%), Ⅱa형 33균주 (75.0%), Ⅱb형 8균주 (18.1%)로 분류 하였다. 모든 균주에서 IS1542 와 IS1216V 가 삽입되어 있었다. vanA 내성유전자 구조분석 결과 모든 균주에서 Enterococcus faecium의 vanA 유전자와 구조적인 차이가 거의 발견 되지 않았다. 병독성 인자 esp유전자 검색 결과는 34균주(77.2%)에서 그 존재를 확인 할 수 있었고 PFGE를 이용한 균 분석 결과는 균주 간 유전적 연관성이 없는 것으로 분석되었다. 결론 : 수집된 44개의 E. faecalis균주의 vanA 내성 유전자 구조분석 결과와 염기서열 분석 및 esp유전자 유무 검색결과는 E. faecium과 비교 했을 때 유의할 만한 차이를 발견 하지 못했다. 유전형 분석 결과도 유전적 관련성이 없는 균주들이 동일한 내성유전자의 구조를 가지는 형태로 나타나 내성 유전자의 수평이동에 의한 VRE의 주요 전파 기전을 확인 할 수 있었다. 장알균중 VRE 발현비율의 두 종간의 차이는 내성유전자의 구조적 차이보다는 Vancomycin을 제외한 대부분의 항생제에 감수성인 E. faecalis에 비해 대부분의 항생제에 내성을 갖는 E. faecium의 내성기전에 의한 것이라 생각된다.
URI
https://dspace.ajou.ac.kr/handle/2018.oak/17813
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Graduate School of Ajou University > Department of Bioscience > 3. Theses(Master)
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